叶子不同、花朵不同、科属不同、外形不同、习性不同。
叶子不同：芙蓉的叶子形状为宽卵形至圆卵形或心形，直径10-15厘米，常5-7裂，叶子上有绒毛，而荷花的叶子为圆盾形，全缘稍呈波状，它的叶子光滑，表面被白粉，直径25-90厘米。
花朵不同：芙蓉的花朵单生于枝端叶腋间，花期在8-10月份，初开时颜色为白色或者粉色，后期变成深红色，而荷花的叶子生长在水面上，它的花期在6-9月份，花朵直径10-20厘米。
科属不同：芙蓉花属于锦葵目锦葵科木槿属；荷花属于毛茛目莲科莲属。
外形不同：芙蓉花作为陆生植物，高度在2-5米左右；荷花是水生植物，其花高托在水面之上。
习性不同：芙蓉花只能地栽，喜光喜温暖不耐寒；荷花生长离不开水域，对水分的需求较大。
芙蓉花是锦葵科木槿属植物，花初开时白色或淡红色，后变深红色，直径约8cm，花瓣近圆形，直径4-5cm，外面被毛，基部具髯毛；雄蕊柱长2.5-3cm，无毛；花柱5，疏被毛。蒴果扁球形，直径约2.5cm，被淡*色刚毛和绵毛，果爿5。种子肾形，背面被长柔毛。
荷花，又称莲花，古称芙蓉、菡萏、芙蕖，毛茛目睡莲科植物，是多年生草本花卉。单生于花梗顶端，花瓣多数，嵌生在花托穴内，有红、粉红、白、紫等颜色。花瓣为水滴形，种子为卵形。性喜相对稳定的平静浅水、湖沼、泽地、池塘等，喜光，极不耐荫。
